显微镜室是园林技术、园艺技术、畜牧兽医等专业的专业基础实验室，面积55平方米，能容纳40名学生同时进行实验。

该实验室主要承担植物解剖、动物病理、微生物学等课程的实验教学工作。始建于1987年，先后投入8万元购置了普通光学显微镜、实体显微镜、电视显微镜、摄影生物显微镜等仪器设备。显微镜室现由环境工程系进行管理及统一安排使用。

在实验过程中通过对细胞、组织及器官解剖构造的观察，使学生了解植物、动物的基本结构特点，熟练掌握使用显微镜的方法。并在实验过程中培养学生严肃认真的科学态度与实事求是的工作作风，为后续的专业课程打下坚实的基础。

实验室有专职技术人员1名，专兼职指导教师5名。实验室有实验室规则、实验员职责等规章制度，实行仪器设备使用登记制度，实验室管理员定期维护仪器。